怎么用GDC下载TCGA肿瘤患者的临床信息
一、GDC简介
GDC(Genomic Data Commons)是美国国立卫生研究院(NIH)推出的一个基因组数据共享平台,它提供了一个完整的基因组数据存储和管理系统,可以帮助研究人员更好地查询,下载,共享和分析数据。GDC支持多种类型的数据,包括测序,组学,变异,结构,表达,临床,病理,药物和环境数据。它可以帮助研究人员更好地了解基因组数据,以及如何将这些数据用于研究。
二、TCGA简介
TCGA(The Cancer Genome Atlas)是由美国国立卫生研究院(NIH)和癌症研究所(NCI)联合发起的一个大型基因组学研究项目,旨在揭示肿瘤发生,发展和治疗的分子机制。它收集了来自肿瘤患者的临床,病理,表达,测序和其他基因组学数据,并提供给研究人员。TCGA数据库中有超过11000个肿瘤患者的数据,其中包括肿瘤基因组,转录组,表达组,甲基化组等多种类型的数据。
三、使用GDC下载TCGA肿瘤患者的临床信息
1、打开GDC网站(https://gdc.cancer.gov),点击“Data Portal”,进入GDC数据门户;
2、点击“TCGA”,进入TCGA数据;
3、点击“Clinical”,进入临床数据;
4、点击“Files”,查看可下载的文件;
5、点击“Add to Cart”,将文件加入购物车;
6、点击“Download Cart”,下载购物车中的文件;
7、点击“Download Manifest”,下载文件列表;
8、点击“Download”,下载文件。
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